降低血清毒素
自然疗法之父一-葛森医师，以煮沸的中度研磨有机咖啡所制成的咖啡液，证明咖啡灌肠是让身体排毒及肝脏复原的有益方法。
1985年，已故的癌症另类疗法专家哈罗德.曼纳(Haroad Manner)博士，在宾州普鲁士王市举办的癌症治疗学术年会上，讨论了咖啡灌肠的体内运作。他向听众宣布，这些生理学的运作是他向葛森博士学到的，葛森博士早在至少30年前就已经用同样的方式详细讲解过这个主题。他将开发出这种治疗癌症的肝脏排毒技巧的贡献，完全归功于葛森博士。接下来几段文字，是改写自曼纳博士对于施行咖啡灌肠时身体清洁机智的说明。
当咖啡灌肠液停留在肠道中时(最佳时间是12到15分钟)，身体所有的血液没3分钟都会通过肝脏1次。直肠血管会因暴露于咖啡因中而扩张，肝门静脉也会跟着扩张。在此同时，胆管随着血流而张开，胆汁流量增加，这些内部器官的平滑肌也会放松。血清及其中诸多成分等重要体液，在流经富含咖啡因的肝脏时可以接受排毒。这946毫升停留在肠道中的水分，能够刺激内脏的神经系统，促进其蠕动。透过肠子输入的水分可稀释胆汁，使胆汁流量变得更大。身体内还会被一种生理学家称为GST的酵素催化剂进一步影响，而冲刷掉有毒的胆汁。
小肠的GST含量会增加为700%，这是相当优秀的生理效果，因为这种酵素可以清除自由基。被清除的自由基会以胆盐的形式，从十二指肠离开肝脏和胆囊。胆盐会被肠子的蠕动带走，从小肠、大肠一路来到直肠。
1990年，曾研究过葛森博士癌症疗法的奥地利医师彼德.雷奇纳博士及其同僚讨论到肠内GST含量增加的益处。当时雷奇纳博士的报告指出:.GST会与胆红素及其glucuronides结合，使它们能够从肝细胞中排除。.GST能够阻断并排除致癌物，这个动作需要活化氧化或还原反应。它催化的功能会产生保护效果，抵御许多化学致癌物。.GST可和几乎所有的高度亲电子物质(自由基)形成共价键，这是将它们排出体外的先决条件。潜在的肝脏毒素中间产物(肝脏毒性细胞抑制剂)也是这一类的自由基病变，故GST也可以清除它。
上述发现公开发表之前，雷奇纳博士就已经在1984年认定，咖啡灌肠拥有非常特定的用途:降低血清毒素。他的医学报告指出:“咖啡灌肠会对结肠产生非常明确的效果，这可以用内视镜观察到。华顿柏和他的同事在1981年证明，咖啡中的棕榈酸可以促进GST和其他配体的活性，使其比一般值高出数倍。这一类的酵素的主要工作，就是负责为胆囊所释放的亲电子自由基进行结合反应。”
从1970年代后期开始，生化学家华顿柏博士主持和监督的实验室，就发现2种棕榈酸的盐类，也就是cafestol palmitate和kahweol palmitate(两者皆存在于咖啡中)，是可能的GST强化因子。经过强化之后，这种酵素会成为主要的排毒系统，催化血流中各式电子接受者(亲电子基)与麸胱甘肽的硫氢基群结合。由于化学物质的最终活性致癌型态就是亲电子基，因此GST系统就成为清除任何现有癌细胞(致癌物排毒)的重要机制。
癌细胞的解毒已经在实验室的小白鼠身上经过无数次的实验证实。将咖啡豆加入这些动物的饮食之中后，它们体内的肝脏排毒增加了600%，小肠排毒增加了700%。自行实施咖啡灌肠的人体内，也同样有类似的效果。
代谢肿瘤的分解产物
咖啡灌肠在退化性疾病的治疗和逆转中扮演十分特定的功能。如同雷奇纳博士指出的，它可以降低血清毒素的含量，名符其实地将毒素从滋养正常细胞的体液中清除干净。当然，血液中永远都有少量的毒素，每个细胞都要承受毒素、缺氧、营养不良或创伤的挑战，这些因素加起来，会改变细胞的分子结构，使其失去对钾的偏好。我们已经说明过，钠会在受损细胞中和钾竞争结合位置。
受损细胞失去钾，钠含量又提高，导致穿过其中的电子流减少。某些生化学家将受损细胞称为“巨分子”，受损的巨分子会失去对顺磁性离子的吸引力，接下来水分子的秩序可能遭到破坏。由于在高能量状态下结构井然的巨观相的水(编注:指肉眼可以观察的水)，是控制细胞水分含量及纯度的主要机制，因此水的结构要是受到任何干扰，都会造成细胞因为过多的水分和细胞外溶质而肿胀。当巨分子的内部环境受到过多水分和细胞外物质污染时，粒腺体产生三磷酸腺苷的功能就会大幅受损。除非去除不利因素，否则这将会导致巨分子无法产生足够的能量进行自我修复。 源自体内的血清毒素，可能是从细菌和恶性肿瘤细胞的巨分子内产生。目前已经观察到，几乎任何活跃中的恶性肿瘤周围，都有一圈受损的正常组织，这些组织的水分结构遭到肿瘤毒素的慢性侵犯所破坏。这些巨分子因为过多的盐和水分而肿胀，导致能量产生和免疫功能都受到抑制。另外，这样的受损组织，血液循环也会减少，因为水肿的细胞体积过大，向内挤压到微血管、小动脉和淋巴管。
葛森博士教导我们，改善血液循环和组织完整性可预防恶性肿瘤的扩散并使其毁灭。他认为如果代谢正常，就不可能存在任何癌症，其理甚明。葛森博士最喜爱用来证明这个事实的例子，就是健康实验动物的组织，一旦接受移植的肿瘤，就会藉有健康宿主本身的发炎反应，将肿瘤迅速杀死--它们可以保护自己不受这些外来蛋白质威胁。为了让移植的恶性细胞能够在实验动物身上活下来，实验室的技术人员得先损坏动物的甲状腺和肾上腺。当然，葛森博士是朝着痊愈和正常化的目标在努力，他希望能够在患者现有肿瘤周围的组织中，创造出接近正常的代谢。
肝脏和小肠中的酵素系统负责转换并中和4种最常见的组织毒素--多胺类、氨，与毒素结合的氮，及亲电子基，它们都能造成细胞和膜的损伤，而咖啡灌肠可大幅提升这些肝脏和肠道防护性酵素系统的有益效果。在葛森博士过世后20年，高度科学性期刊《生理化学与物理》的编辑们重印了他的著作之一作为表扬。他们证实:“咖啡灌肠能使胆管扩张，透过肝脏排掉有毒的肿瘤分解产物，并藉由结肠壁进行的血液透析将毒性产物排出。”
缓解疼痛
在华顿柏博士和雷奇纳博士报告他们的发现前，医疗记者马克.麦卡提(Mark F.McCarty)已经于1981年在《医学假说》期刊上写道:“1946年有关癌症研究的参议院特别小组委员会中，5名曾经私下接触受过葛森博士治疗的患者的独立医师，来信表示他们对自己看到的结果感到十分讶异和振奋，并且督促为包含咖啡灌肠在内的治疗方式进行广泛的试验。其中一名医师指称，‘大约90%的案例中都能缓解严重的疼痛’。”
这些可追溯至1946年的观察记录在当时是真实的，现在也依旧正确。虽然不灌肠者，以及强调自己比较喜欢在附近的星巴克店面享用咖啡的人，听到使用咖啡灌肠的反应经常是震惊和笑声，不过这些人同样可以经由直肠接受咖啡，而获得极大的益处。他们可以得到这种排毒方式的益处，藉此摆脱任何来源的疼痛与不适。从患者的观点来看，咖啡灌肠能够缓解神智混乱、一般神经紧张、忧郁、许多与过敏相关的症状，以及最重要的，缓解严重疼痛，无论这些症状是哪一种退化性疾病造成的。
刺激胆汁流出
咖啡灌肠是自成一格的健康疗养。口服咖啡饮料的效果和直肠施予的咖啡完全无法相提并论。相反的，饮用咖啡其实会迫使有毒的胆汁被再吸收。其他被分类为胆汁分泌促进剂(利胆剂)的药物虽然会增加肝脏分泌的胆汁量，但是几乎不会增进肝脏酵素系统的任何排毒功能。利胆剂完全无法确保胆汁能够从肠子中通过，到达直肠排出。生理学上的事实是，被身体再吸收的胆汁，通常可高达随着粪便排出肠道者的10倍。
咖啡灌肠强化酵素的能力在利胆剂中相当独特。由于它不允许肝脏经由肠壁再吸收有毒的胆汁，因此完全是一种透过肝脏及小肠中现有的酵素系统，排除血流中毒素的有效工具。由于临床实务让使用葛森疗法的临床医师们知道，病人完全能够忍受频繁至一整天内每4小时1次的咖啡灌肠，因此咖啡灌肠应该在医学文献中归类为唯一一种不会再吸收、有效又可重复使用的利胆剂。这样的分类方式，将可为需要快速吸收力且又不重复利用胆汁的疾病治疗发挥莫大助益。
咖啡灌肠的好处
葛森博士对咖啡灌肠的生理作用和效果作出了假设，并且观察到咖啡灌肠在临床上的帮助。
将946毫升煮沸的咖啡溶液注入结肠，可达成下列生理的益处：
1.稀释肝门静脉血流，让胆汁也跟着被稀释。
2.茶碱和可可碱，也就是咖啡主要的营养保健成分，可让血管扩张，对抗肠道的发炎反应。
3.咖啡的棕榈酸盐能够强化GST，而这正是负责移除血清中许多毒性自由基的酵素。
4.灌肠液本身会刺激内脏神经系统、促进蠕动，以及将稀释的毒性胆汁从十二指肠输送到直肠。
由于具刺激性的灌肠液会停留最多15分钟，而且体内所有血液大约每3分钟就会通过肝脏1次，因此咖啡灌肠代表着一种透过肠壁进行血液透析的形式。
咖啡灌肠在搭配葛森饮食疗法使用时安全无虞。葛森博士的饮食疗法，也就是“限制钠、高钾、高微量营养素的水果、蔬菜、完整谷类”，旨在提供所有细胞呼吸和能量生成所需的已知及未知营养素。高钾低钠的环境，倾向于使细胞巨分子回到正常状态，并改善水分结构及水含量。葛森博士还以醋酸钾、单磷酸钾和葡萄糖酸钾补充饮食中的钾盐，饮食中经常食用的苹果又能补充苹果酸盐，改善粒腺体生产能量时柠檬酸循环（又称克氏循环）的效率。克氏循环是一系列酵素反应，在这些反应中，身体利用碳水化合物、蛋白质和脂肪，产生二氧化碳、水和能量，用于器官的运作。
葛森博土以限制动物性蛋白质，作为退化性疾病患者的暂时治疗措施。这种方法早在19世纪晚期，就被观察到有助于减少细胞水肿。施予高负荷剂量（指给药时的较高起始剂量，通常之后会因疗程的进展而调整下降为较低的“维持剂量”）的甲状腺激素和鲁格尔试剂，可以让拥有自己的DNA和RNA、可独立于细胞外自行复制的粒腺体增生。甲状腺能改善细胞的糖类氧化，借此增加三磷腺苷的生产量，让细胞能量显著提升。
葛森博士认为，这许许多多的治疗机制，包括咖啡灌肠在内，可以达到下列效果：
1.减少血清毒素，去除受损正常细胞（巨分子）的慢性障碍。
2.改善细胞的钾离子含量。
3.减少细胞的钠含量。
4.借由改善水结构而减少细胞肿胀。
5.增加细胞粒腺体的数量和活性。
6.供应细胞产生能量和修复所需的微量营养素。
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